La regla mas simple y sencilla seria excluir esa carpeta de ser reescrita, por tanto tan solo deberíamos crear un htaccess en dicha carpeta y pegar:

Pero no siempre es factible usar la regla anterior, pudiera darse el caso que ya tenemos un htaccess creado y con el OFF se nos modifica alguna regla, en este caso en el htaccess principal haríamos lo siguiente (coloco ejemplo completo de regla mod_rewrite y bloqueo de una carpeta):

En el caso que fueran varias carpetas, sería: