Actualizado el domingo, 19 junio, 2016
Existen diversas aplicaciones (por ejemplo Nautilus) que realizarían este tipo de operaciones casi a la perfección. Pero siempre existe ese «casi» en el cual deberemos realizarlo de forma manual, puede ser por necesidad o por el simple echo de que preferimos la consola.
Copiar un unico archivo a pendrive:
sudo cp /home/tu-usuario/Documentos/midocumento.doc /media/mi-pendrive
Copiar una carpeta a pendrive:
sudo cp -r /home/tu-usuario/Documentos /media/mi-pendrive
Copiar archivos, carpetas y subcarpetas sin crear carpeta principal:
sudo cp -r /home/tu-usuario/Documentos/* /media/mi-pendrive
Copiar archivos, carpetas y subcarpetas sobrescribiendo archivos en destino:
sudo cp -rf /home/tu-usuario/Documentos/* /media/mi-pendrive
Copiar archivos, carpetas y subcarpetas preguntando si desea sobrescribir datos de destino:
sudo cp -ri /home/tu-usuario/Documentos/* /media/mi-pendrive